L’équipe est alertée par la police à propos du meurtre d’un programmateur informatique indépendant qui a travaillé pour la cybersécurité de la Navy. Granger décide de mettre Callen et Hanna sur cette affaire alors qu’ils sont en mission d’infiltration. Furieux que leur couverture soit compromise, les deux partenaires s’exécutent néanmoins et commencent par interroger la sœur de la victime. Parallèlement, Hetty se trouve à Washington pour justifier la mission de Kensi en Afghanistan.