Un agent de l’ATF qui était infiltré dans un gang de yakuzas est froidement exécuté. La vidéo de son assassinat est postée sur Internet. La victime enquêtait seul sur des marins qui avaient mis en place un trafic d’armes. Sam et Callen arrêtent l’un de ses jeunes informateurs et l’interrogent. Parallèlement, en Afghanistan, Owen Granger tente de retrouver la trace de Kensi qui a disparu. Il ignore qu’elle s’est laissé capturer pour localiser le Fantôme blanc.