Sur le port de Malibu, un homme est étranglé après avoir remis une enveloppe à un officier du renseignement américain. L’agent, estimé par sa hiérarchie, disparaît sans laisser de trace. Partis à sa recherche, Callen et son équipe découvrent qu’il enquêtait sur Antonio Medina, un homme politique vénézuélien en déplacement à Los Angeles. Parallèlement, Deeks doit suivre un programme de formation continue.