Alors qu’ils sont en mission pour faire tomber le chef de Codex, Mac et son équipe découvrent que Murdoc (David Dastmalchian) a piraté leurs intercoms et les écoute depuis des mois. Il est temps pour l’équipe d’arrêter Murdoc qui s’est associé à Andrews (Joe Pantoliano) que l’équipe a fait échapper quelque temps plus tôt, alors qu’ils prévoient de tuer des milliers de personnes et de révéler les plus grands secrets des agents de la fondation Phoenix.