En essayant de se connecter avec la machine, Peter est tombé dans le coma, blessé assez gravement. Olivia fait équipe avec Sam Weiss, celui qui semble détenir des informations sur la machine. Dehors, des éclairs et des décharges électriques frappent une grande partie de l’Etat, provoquant un début de panique. En compagnie de Sam Weiss, Olivia part à la recherche d’une «clé» qui permettrait de comprendre comment fonctionne la machine et qui pourrait permettre à Peter d’en reprendre le contrôle…